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病毒分類表

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本頁面列出了病毒的分類,包含病毒以及類病毒普利昂蛋白衛星病毒亞病毒因子

生物分類表

由於病毒並不像其他生物能藉由交配產生後代,因此在種別的定義上與一般生物有所不同。

概論

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ICTV 分類法

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國際病毒分類委員會(英文:International Committee on Taxonomy of Viruses,簡稱 ICTV)是國際微生物學聯合會(英文:International Union of microgical Societies)發展、改進和維護通用病毒分類的唯一機構,在1966年建立起了一個病毒分類的通用系統和統一的命名法則。第七屆 ICTV 會議首次規範化了病毒物種的概念,即病毒分類的分支層次中的最低分類單元[1]。分類的主要依據是病毒顆粒的特性、抗原特性與生物特性。

到目前為止只有一小部分的病毒得到了研究,從來自人體的病毒樣品中發現有20%的序列是未曾發現過的,而來自環境中(如海水、大洋沉積物等)的病毒樣品則大部分的序列都是全新的[2]

病毒分類從域開始,結構如下,分類後綴在括號中:[3]

英語Realm (virology) Realm(-viria
亞域 Subrealm(-vira
Kingdom(-viriae
亞界 Subkingdom(-virites
Phylum(-viricota
亞門 Subphylum(-viricotina
Class(-viricetes
亞綱 Subclass(-viricetidae
Order(-virales
亞目 Suborder(-virineae
Family(-viridae
亞科 Subfamily(-virinae
Genus(-virus
亞屬 Subgenus(-virus
Species

物種名稱通常以[疾病]病毒的形式出現,尤其是高等動植物。 ICTV 2023版分類表中總共有6個域、10個界、18個門、2個亞門、41個綱、81個目、11個亞目、314個科、200個亞科、3522個屬、84個亞屬與14690個種。除亞域、亞界和亞綱外,其他級別的分類單元都被使用。共有6個域、1個地位未定綱、22個地位未定科及2個地位未定屬被承認[4]

巴爾的摩分類法

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巴爾的摩分類法是基於病毒 mRNA 的合成方式

諾貝爾獎獲得者生物學家戴維·巴爾的摩在1970年代提出了巴爾的摩分類系統[5]。巴爾的摩分類法與ICTV分類法一起用於現代病毒的分類[6][7][8]

巴爾的摩分類法是基於病毒 mRNA 的生成機制。在從病毒基因組到蛋白質的過程中,必須要生成mRNA來完成蛋白質合成和基因組的複製,但每一個病毒家族都採用不同的機制來完成這一過程。病毒基因組可以是單鏈或雙鏈的 RNADNA,可以有也可以沒有反轉錄酶。而且,單鏈RNA病毒可以是正義(+)或反義(-)。這一分類法將病毒分為7類:

舉一個病毒分類的例子:水痘病毒,即帶狀疱疹病毒,屬於疱疹病毒目疱疹病毒科甲型疱疹病毒亞科水疱病毒屬;同時,帶狀疱疹病毒是巴爾的摩分類法中的第一類,因為它是雙鏈 DNA 病毒,且不含有反轉錄酶。

ICTV 2023版病毒分類表

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此套分類系統與細胞生物分類系統有許多共同特徵,如分類單元結構,但也存在一些差異,比如所有分類名稱都使用斜體,這與國際藻類、真菌和植物命名法國際動物命名法不同。

包含4界

包含2界、2科、4屬

核酶病毒域 Ribozyviria

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包含2界

地位未定種類

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地位未定綱:

地位未定科:

地位未定屬:

亞病毒因子(Subviral Agents)

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衛星(Satellites)

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  • 衛星病毒 Satellite virus
    • 單鏈核糖核酸衛星病毒 Single-stranded RNA satellite virus
    • 雙鏈 DNA 衛星病毒 Double-stranded DNA satellite virus
    • 未定屬
  • Satellite nucleic acid
    • Single-stranded satellite DNA
    • Double-stranded satellite RNA
    • Single-stranded satellite RNA
    • RNA satellite
    • 未定屬

類病毒(Viroids)

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  • Pospiviroidae
    • Pospiviroid
    • Hostuviroid
    • Cocadviroid
    • Apscaviroid
    • Coleviroid
    • 未定屬
  • Avsunviroidae
    • Avsunviroid
    • Pelamoviroid
    • Elaviroid
  • 未定科

朊毒體(Prions)

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  • Mammal-prion
  • Fungi-prion

干擾缺損病毒(Defective Interfering)

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  • 缺損干擾 RNA Defective Interfering RNA
  • Defective interfering particle

參考文獻

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  1. ^ Fields p. 27
    • As defined therein, "a virus species is a polythetic class of viruses that constitute a replicating lineage and occupy a particular ecological niche". A「polythetic" class is one whose members have several properties in common, although they do not necessarily all share a single common defining one. Members of a virus species are defined collectively by a consensus group of properties. Virus species thus differ from the higher viral taxa, which are「universal」classes and as such are defined by properties that are necessary for membership.
  2. ^ Delwart, E.L. Viral metagenomics. Rev. Med. Virol.. 2007, 17 (2): 115–131. PMID 17295196. doi:10.1002/rmv.532. 
  3. ^ ICTV Code. talk.ictvonline.org. International Committee on Taxonomy of Viruses. [2020-04-26]. (原始內容存檔於2018-07-12). 
  4. ^ Virus Taxonomy: 2020 Release. talk.ictvonline.org. International Committee on Taxonomy of Viruses. [2020-04-26]. (原始內容存檔於2020-03-20). 
  5. ^ Baltimore, D. The strategy of RNA viruses. Harvey Lect.. 1974,. 70 Series: 57–74. PMID 4377923. 
  6. ^ van Regenmortel, M.H.; Mahy, B.W. Emerging issues in virus taxonomy. Emerging Infect. Dis.. 2004, 10 (1): 8–13. PMID 15078590. 
  7. ^ Mayo, M.A. Developments in plant virus taxonomy since the publication of the 6th ICTV Report. International Committee on Taxonomy of Viruses. Arch. Virol.. 1999, 144 (8): 1659–1666. PMID 10486120. doi:10.1007/s007050050620. 
  8. ^ de Villiers, E.M.; Fauquet, C.; Broker, T.R.; Bernard, H.U. & zur Hausen, H. Classification of papillomaviruses. Virology. 2004, 324 (1): 17–27. PMID 15183049. doi:10.1016/j.virol.2004.03.033.