病毒分類表
本頁面列出了病毒的分類，包含病毒以及類病毒、普利昂蛋白、衛星病毒等亞病毒因子。
| 生物分類表 |
由於病毒並不像其他生物能藉由交配產生後代，因此在種別的定義上與一般生物有所不同。
概論
[編輯]ICTV 分類法
[編輯]國際病毒分類委員會（英文：International Committee on Taxonomy of Viruses，簡稱 ICTV）是國際微生物學聯合會（英文：International Union of microgical Societies）發展、改進和維護通用病毒分類的唯一機構，在1966年建立起了一個病毒分類的通用系統和統一的命名法則。第七屆 ICTV 會議首次規範化了病毒物種的概念，即病毒分類的分支層次中的最低分類單元[1]。分類的主要依據是病毒顆粒的特性、抗原特性與生物特性。
到目前為止只有一小部分的病毒得到了研究，從來自人體的病毒樣品中發現有20%的序列是未曾發現過的，而來自環境中（如海水、大洋沉積物等）的病毒樣品則大部分的序列都是全新的[2]。
病毒分類從域開始，結構如下，分類後綴在括號中：[3]
- 域 Realm（-viria）
物種名稱通常以[疾病]病毒的形式出現，尤其是高等動植物。 ICTV 2023版分類表中總共有6個域、10個界、18個門、2個亞門、41個綱、81個目、11個亞目、314個科、200個亞科、3522個屬、84個亞屬與14690個種。除亞域、亞界和亞綱外，其他級別的分類單元都被使用。共有6個域、1個地位未定綱、22個地位未定科及2個地位未定屬被承認[4]。
巴爾的摩分類法
[編輯]
諾貝爾獎獲得者生物學家戴維·巴爾的摩在1970年代提出了巴爾的摩分類系統[5]。巴爾的摩分類法與ICTV分類法一起用於現代病毒的分類[6][7][8]。
巴爾的摩分類法是基於病毒 mRNA 的生成機制。在從病毒基因組到蛋白質的過程中，必須要生成mRNA來完成蛋白質合成和基因組的複製，但每一個病毒家族都採用不同的機制來完成這一過程。病毒基因組可以是單鏈或雙鏈的 RNA 或 DNA，可以有也可以沒有反轉錄酶。而且，單鏈RNA病毒可以是正義（+）或反義（-）。這一分類法將病毒分為7類：
- 第一類是雙鏈 DNA 病毒（如腺病毒、疱疹病毒、痘病毒）
- 第二類是單鏈 DNA 病毒（+）DNA（如小 DNA 病毒）
- 第三類是雙鏈RNA病毒（如呼腸孤病毒）
- 第四類是（+）單鏈RNA病毒（如微小核糖核酸病毒、披蓋病毒）
- 第五類是（-）單鏈RNA病毒（如正黏液病毒、炮彈病毒）
- 第六類是單鏈RNA反轉錄病毒（如反轉錄病毒）
- 第七類是雙鏈 DNA 反轉錄病毒（如肝病毒）
舉一個病毒分類的例子：水痘病毒，即帶狀疱疹病毒，屬於疱疹病毒目，疱疹病毒科，甲型疱疹病毒亞科，水疱病毒屬；同時，帶狀疱疹病毒是巴爾的摩分類法中的第一類，因為它是雙鏈 DNA 病毒，且不含有反轉錄酶。
ICTV 2023版病毒分類表
[編輯]此套分類系統與細胞生物分類系統有許多共同特徵，如分類單元結構，但也存在一些差異，比如所有分類名稱都使用斜體，這與國際藻類、真菌和植物命名法及國際動物命名法不同。
- 齊利希病毒界 Zilligvirae 1門
雙鏈去氧核糖核酸病毒域 Duplodnaviria
[編輯]- 香港病毒界 Heunggongvirae 2門
- 衣殼病毒門 Peploviricota 1綱
- 尾噬菌體門 Uroviricota 1綱
- 有尾噬菌體綱 Caudoviricetes 1目
- 有尾噬菌體目 Caudovirales
- crAss噬菌體目 Crassvirales
- 海港噬菌體目 Juravirales
- 千面噬菌體目 Kirjokansivirales
- 海洋組噬菌體目 Magrovirales
- 敖廣噬菌體科 Aoguangviridae
- 甲烷杆噬菌體目 Methanobavirales
- 納孔噬菌體目 Nakonvirales
- 蘇雷瑪噬菌體目 Thumleimavirales
- 埃凱曼病毒科 Ackermannviridae
- 集聚噬菌體科 Aggregaviridae
- 艾莉絲·埃文斯噬菌體科 Aliceevansviridae
- 阿倫伯格噬菌體科 Arenbergviridae
- 規範噬菌體科 Assiduviridae
- 自複製短尾噬菌體科 Autographiviridae
- 卡斯金斯噬菌體科 Casjensviridae
- 蔡斯噬菌體科 Chaseviridae
- 科 Chimalliviridae
- 科 Clermontviridae
- 德默萊茲噬菌體科 Demerecviridae
- 德雷克斯勒噬菌體科 Drexlerviridae
- 杜恩噬菌體科 Duneviridae
- 熱噬菌體科 Fervensviridae
- 凡賽提噬菌體科 Forsetiviridae
- 弗雷德·法斯蒂爾噬菌體科 Fredfastierviridae
- 格里蒙噬菌體科 Grimontviridae
- 格蘭噬菌體科 Guelinviridae
- 赫爾戈蘭噬菌體科 Helgolandviridae
- 赫萊爾噬菌體科 Herelleviridae
- 克列茲考斯卡噬菌體科 Kleczkowskaviridae
- 科 Konodaiviridae
- 藍綠噬藻體科 Kyanoviridae
- 科 Lutetiaviridae
- 瑪薩噬菌體科 Madisaviridae
- 馬德里噬菌體科 Madridviridae
- 梅西揚日諾夫噬菌體科 Mesyanzhinovviridae
- 莫利可噬菌體科 Molycolviridae
- 友好噬菌體科 Naomviridae
- 奧拉-詹森噬菌體科 Orlajensenviridae
- 厚噬菌體科 Pachyviridae
- P2噬菌體科 Peduoviridae
- 漫遊噬菌體科 Pervagoviridae
- 普切斯噬菌體科 Pootjesviridae
- 刺噬菌體科 Pungoviridae
- 朗特里噬菌體科 Rountreeviridae
- 薩弗曼噬菌體科 Saffermanviridae
- 薩拉瑪噬菌體科 Salasmaviridae
- 豬尾噬菌體科 Saparoviridae
- 斯基托噬菌體科 Schitoviridae
- 希望噬菌體科 Speroviridae
- 斯坦·威廉噬菌體科 Stanwilliamsviridae
- 斯特拉波噬菌體科 Straboviridae
- 鹽菌噬菌體科 Suolaviridae
- 富山噬菌體科 Toyamaviridae
- 梅園噬菌體科 Umezonoviridae
- 維爾丹尼噬菌體科 Verdandiviridae
- 翻轉噬菌體科 Vertoviridae
- VLM群噬菌體科 Vilmaviridae
- 維諾噬菌體科 Winoviridae
- 科 Zierdtviridae
- 佐貝爾噬菌體科 Zobellviridae
- 有尾噬菌體綱 Caudoviricetes 1目
單鏈去氧核糖核酸病毒域 Monodnaviria
[編輯]包含4界
- 洛布病毒界 Loebvirae 1門
- 桑格病毒界 Sangervirae 1門
- 稱徳病毒界 Shotokuvirae 2門
- 科薩特病毒門 Cossaviricota 3綱
- 單環編碼病毒門 Cressdnaviricota 2綱：編碼複製相關蛋白的環狀單鏈 DNA 病毒（Circular replication-associated protein-encoding single-stranded DNA viruses，CRESS DNA viruses）
- 精氨酸指針病毒綱 Arfiviricetes 5目
- 硅藻病毒目 Baphyvirales 1科
- 硅藻 DNA 病毒科 Bacilladnaviridae
- 圓環病毒目 Cirlivirales 3科
- CRESS亞基因組目 Cremevirales 1科
- 小環狀 DNA 病毒科 Smacoviridae
- 連環病毒目 Gredzevirales
- 耶夢病毒目 Jormunvirales
- 德羅普尼病毒科 Draupnirviridae
- 多分體基因病毒目 Mulpavirales 3科
- 動物CRESS病毒科 Anicreviridae
- 中介病毒科Metaxyviridae
- 矮縮病毒科 Nanoviridae
- 圓形 CRESS 病毒目 Recrevirales 1科
- 圓形病毒科 Redondoviridae
- 戒環病毒目 Ringavirales
- 秘魯圓環樣病毒科 Pecoviridae
- 幽谷病毒目 Rivendellvirales
- 納雅病毒科 Naryaviridae
- 洛汗病毒目 Rohanvirales
- 鎮星病毒目 Saturnivirales
- 硅藻病毒目 Baphyvirales 1科
- Rep 單鏈編碼病毒綱 Repensiviricetes 1目
- 雙生基因植物真菌病毒目 Geplafuvirales 3科
- 精氨酸指針病毒綱 Arfiviricetes 5目
- 特拉帕尼病毒界 Trapavirae 1門
包含2界、2科、4屬
- 正 RNA 病毒界 Orthornavirae 6門
- 雙義病毒門 Ambiviricota
- 雙鏈 RNA 病毒門 Duplornaviricota 3綱
- 金巨全病毒綱 Chrymotiviricetes 1目
- 加布里埃爾病毒目 Ghabrivirales 4科
- 亞目 Alphatotivirineae
- 科 Botybirnaviridae
- 金色病毒科 Chrysoviridae
- 科 Fusagraviridae
- 巨大雙分RNA病毒科 Megabirnaviridae
- 科 Monocitiviridae
- 科 Orthototiviridae
- 科 Phlegiviridae
- 科 Pseudototiviridae
- 四組分病毒科 Quadriviridae
- 科 Spiciviridae
- 亞目 Betatotivirineae
- 科 Artiviridae
- 科 Giardiaviridae
- 科 Inseviridae
- 科 Lebotiviridae
- 科 Megatotiviridae
- 科 Ootiviridae
- 科 Pistolviridae
- 科 Yadonushiviridae
- 亞目 Gammatotivirineae
- 鏈格病毒科 Alternaviridae
- 亞目 Alphatotivirineae
- 加布里埃爾病毒目 Ghabrivirales 4科
- 呼腸孤病毒綱 Resentoviricetes 1目
- 維達弗病毒綱 Vidaverviricetes 1目
- 金巨全病毒綱 Chrymotiviricetes 1目
- 黃色病毒門 Kitrinoviricota 4綱
- 光滑裸露病毒門 Lenarviricota 4綱
- 二十病毒綱 Amabiliviricetes 1目
- 元素病毒目 Wolframvirales 1科
- 裸露 RNA 病毒科 Narnaviridae
- 元素病毒目 Wolframvirales 1科
- 豪厄爾鎮病毒綱 Howeltoviricetes 1目
- 板栗疫病真菌病毒菌目 Cryppavirales 1科
- 線粒體病毒科 Mitoviridae
- 板栗疫病真菌病毒菌目 Cryppavirales 1科
- 光滑病毒綱 Leviviricetes 2目
- 密病毒綱 Miaviricetes 1目
- 二十病毒綱 Amabiliviricetes 1目
- 負核糖病毒門 Negarnaviricota 2亞門
- 簡單病毒亞門 Haploviricotina 4綱
- 複雜病毒亞門 Polyploviricotina 2綱
- 布尼亞病毒綱 Bunyaviricetes
- 流感鮭貧血索戈託病毒綱 Insthoviricetes 1目
- 托州病毒科 Tosoviridae
- 小 RNA 病毒超群門 Pisuviricota 3綱
- 雙鏈-小雙節 RNA 病毒綱 Duplopiviricetes 1目
- 小南嵌套病毒綱 Pisoniviricetes 3目
- 網巢病毒目 Nidovirales（嵌套病毒目）8亞目
- 深海病毒亞目 Abnidovirineae 1科
- 深海病毒科 Abyssoviridae 1亞科
- 動脈炎嵌套病毒亞目 Arnidovirineae 4科
- 冠狀病毒亞目 Cornidovirineae 1科
- 冠狀病毒科 Coronaviridae 2亞科
- 中型嵌套病毒亞目 Mesnidovirineae 2科
- 單嵌套病毒亞目 Monidovirineae 1科
- 單嵌套病毒科 Mononiviridae 1亞科
- 南海嵌套病毒亞目 Nanidovirineae 2科
- 桿狀網巢病毒亞目 Ronidovirineae 2科
- 曲凸嵌套病毒亞目 Tornidovirineae 1科
- [曲杆嵌套病毒科]] Tobaniviridae 4亞科
- 深海病毒亞目 Abnidovirineae 1科
- 微小核糖核酸病毒目 Picornavirales 8科
- 杯狀病毒科 Caliciviridae
- 雙順反子病毒科 Dicistroviridae
- 傳染性軟腐病病毒科 Iflaviridae
- 海洋 RNA 病毒科 Marnaviridae
- 新穎病毒科 Noraviridae
- 小核糖核酸病毒科 Picornaviridae
- 多順反子類小 RNA 病毒科 Polycipiviridae
- 伴生豇豆病毒科 Secoviridae 1亞科
- 紅火蟻病毒科 Solinviviridae
- 南方菜豆花葉病病毒目 Sobelivirales 3科
- 囊孢蟲RNA病毒科 Alvernaviridae
- 杯狀 RNA 病毒科 Barnaviridae
- 南方菜豆花葉一品紅病毒科 Solemoviridae
- 網巢病毒目 Nidovirales（嵌套病毒目）8亞目
- 星狀-馬鈴薯病毒綱 Stelpaviricetes 2目
- 借宿病毒目 Yadokarivirales 1 family
- 借宿病毒科 Yadokariviridae 2 genera
- 裸露病毒科 Hadakaviridae
- 雙 RNA 病毒科 Birnaviridae
- 複製酶置換四體病毒科 Permutotetraviridae
- 葡萄孢菌病毒屬 Botybirnavirus 1種
- 副RNA病毒界 Pararnavirae 1門
- 多真菌病毒科 Polymycoviridae
- 小節肢動物病毒科 Sarthroviridae
- 煙草壞死衛星病毒屬 Albetovirus 3種
- 綠蘿衛星病毒屬 Aumaivirus
- 黍花葉衛星病毒屬 Papanivirus
- 煙草花葉衛星病毒屬 Virtovirus
- 三角病毒科 Kolmioviridae
多變去氧核糖核酸病毒域 Varidnaviria
[編輯]包含2界
- 班福病毒界 Bamfordvirae 2門
- 核質病毒門 Nucleocytoviricota 2綱
- 質體前體病毒門 Preplasmiviricota 3綱
- 雅拉病毒科 Yaraviridae
- 海爾維蒂病毒界 Helvetiavirae（瑞士病毒）1門
地位未定種類
[編輯]地位未定綱:
- 節肢動物核大DNA病毒綱 Naldaviricetes 1目、1科
地位未定科:
- 阿爾法衛星病毒科 Alphasatellitidae 3亞科
- 瓶狀病毒科 Ampullaviridae 1屬
- 指環病毒科 Anelloviridae 31屬
- 鱷梨日斑類病毒科 Avsunviroidae 3屬
- 巴通體GTA組病毒科 Bartogtaviriformidae
- 雙尾病毒科 Bicaudaviridae 1屬
- 短螺旋體GTA組病毒科 Brachygtaviriformidae
- 棒狀病毒科 Clavaviridae 1屬
- 微小紡錘形噬菌體科 Fuselloviridae 2屬
- 球狀病毒科 Globuloviridae 1屬
- 滴狀病毒科 Guttaviridae 2屬
- 嗜鹽紡錘形噬菌體科 Halspiviridae 1屬
- 伊察姆納病毒科 Itzamnaviridae
- 卵形病毒科 Ovaliviridae 1屬
- 芽生噬菌體科 Plasmaviridae 1屬
- 多去氧核糖核酸病毒科 Polydnaviridae 2屬
- 帶球病毒科 Portogloboviridae 1屬
- 馬鈴薯紡錘形塊莖類病毒科 Pospiviroidae 5屬
- 紅細菌目GTA組病毒科 Rhodogtaviriformidae
- 螺旋病毒科 Spiraviridae 1屬
- 奇古菌紡錘形噬菌體科 Thaspiviridae 1屬
- 番茄曲葉衛星病毒科 Tolecusatellitidae 2屬
地位未定屬:
- 溝鞭藻 DNA 病毒屬 Dinodnavirus 1種
- 壺菌病毒屬 Rhizidiovirus 1種
- 衛星病毒 Satellite virus
- 單鏈核糖核酸衛星病毒 Single-stranded RNA satellite virus
- 雙鏈 DNA 衛星病毒 Double-stranded DNA satellite virus
- 未定屬
- Satellite nucleic acid
- Single-stranded satellite DNA
- Double-stranded satellite RNA
- Single-stranded satellite RNA
- RNA satellite
- 未定屬
- Pospiviroidae
- Pospiviroid
- Hostuviroid
- Cocadviroid
- Apscaviroid
- Coleviroid
- 未定屬
- Avsunviroidae
- Avsunviroid
- Pelamoviroid
- Elaviroid
- 未定科
- Mammal-prion
- Fungi-prion
- 缺損干擾 RNA Defective Interfering RNA
- Defective interfering particle
參考文獻
[編輯]- ^ Fields p. 27
- As defined therein, "a virus species is a polythetic class of viruses that constitute a replicating lineage and occupy a particular ecological niche". A「polythetic" class is one whose members have several properties in common, although they do not necessarily all share a single common defining one. Members of a virus species are defined collectively by a consensus group of properties. Virus species thus differ from the higher viral taxa, which are「universal」classes and as such are defined by properties that are necessary for membership.
- ^ Delwart, E.L. Viral metagenomics. Rev. Med. Virol.. 2007, 17 (2): 115–131. PMID 17295196. doi:10.1002/rmv.532.
- ^ ICTV Code. talk.ictvonline.org. International Committee on Taxonomy of Viruses. [2020-04-26]. （原始內容存檔於2018-07-12）.
- ^ Virus Taxonomy: 2020 Release. talk.ictvonline.org. International Committee on Taxonomy of Viruses. [2020-04-26]. （原始內容存檔於2020-03-20）.
- ^ Baltimore, D. The strategy of RNA viruses. Harvey Lect.. 1974,. 70 Series: 57–74. PMID 4377923.
- ^ van Regenmortel, M.H.; Mahy, B.W. Emerging issues in virus taxonomy. Emerging Infect. Dis.. 2004, 10 (1): 8–13. PMID 15078590.
- ^ Mayo, M.A. Developments in plant virus taxonomy since the publication of the 6th ICTV Report. International Committee on Taxonomy of Viruses. Arch. Virol.. 1999, 144 (8): 1659–1666. PMID 10486120. doi:10.1007/s007050050620.
- ^ de Villiers, E.M.; Fauquet, C.; Broker, T.R.; Bernard, H.U. & zur Hausen, H. Classification of papillomaviruses. Virology. 2004, 324 (1): 17–27. PMID 15183049. doi:10.1016/j.virol.2004.03.033.
| 構造 | |
|---|---|
| 生命週期 | |
| 遺傳學 | |
| 依宿主分類 | |
| 其他 | |
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