國際化合物標識
外觀
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開發者 | InChI Trust |
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首次發布 | 2005年4月15日[1][2] |
目前版本 |
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原始碼庫 | |
作業系統 | Microsoft Windows及類Unix系統 |
平台 | IA-32 and x86-64 |
檔案大小 | 4.3 MB |
語言 | 英語 |
許可協定 | IUPAC / InChI Trust Licence |
網站 | [失效連結] |
國際化合物標識(InChI,英語:International Chemical Identifier)是由國際純粹與應用化學聯合會和國家標準技術研究所聯合制定的,用以唯一標識化合物IUPAC名稱的字串。
例子
[編輯]1 | CH3—CH2—OH 乙醇 |
InChI=1/C2H6O/c1-2-3/h3H,2H2,1H3 |
2 | ![]() 維生素C |
InChI=1/C6H8O6/c7-1-2(8)5-3(9)4(10)6(11)12-5/h2,5,7-10H,1H2/t2-,5+/m0/s1 |
層
[編輯]國際化合物標識分為六個層,每個層之間以「/」分隔,並在開頭以一個小寫字母標明層的性質:
- 主層:以「1」表示
- 電荷層:以「q」表示
- 立體化學層:以「t」,「m」,「s」表示
- 異構物層(Isotopic layer):以「i」表示
- 固定氫原子(Fixed-H layer):以「f」表示
- 再連接層(Reconnected Layer):以「r」表示
其中主層是必不可少的,其他的層是可以省略的。
子層
[編輯]每個層都可以分成若干子層(sub-layer),比如主層可以分成以下三個子層:
InChIKey
[編輯]InChIKey是InChI的雜湊函式,其長度為固定的27字元,適用於在資料庫或網際網路中進行檢索。其無法被直接解讀為InChI明文。
舉例
[編輯]以維生素C的InChI為例:
1/C6H8O6 | /c7-1-2(8)5-3(9)4(10)6(11)12-5 | /h2,5,7-10H,1H2 | /t2-,5+/m0/s1 |
化學式層 | 原子連接層 | 氫原子層 | 立體化學層 |
該物質的InChIKey則為CIWBSHSKHKDKBQ-JLAZNSOCSA-N
。
註釋
[編輯]- ^ IUPAC International Chemical Identifier Project Page. IUPAC. [2012-12-05]. (原始內容存檔於2012-05-27).
- ^ Heller, Stephen; McNaught, Alan; Stein, Stephen; Tchekhovskoi, Dmitrii; Pletnev, Igor. InChI - the worldwide chemical structure identifier standard. Journal of Cheminformatics (Springer Nature). 2013, 5 (1): 7. ISSN 1758-2946. doi:10.1186/1758-2946-5-7.
- ^ Release 1.07.1. 2024年8月21日 [2024年8月31日].
參見
[編輯]外部連結
[編輯]文件和演示文稿
[編輯]- InChI Trust site(頁面存檔備份,存於網際網路檔案館)
- IUPAC InChI site(頁面存檔備份,存於網際網路檔案館)
- Unofficial InChI FAQ(頁面存檔備份,存於網際網路檔案館)
- InChI Technical ManualPDF (335 KB)
- [1](頁面存檔備份,存於網際網路檔案館)
- Description of the canonicalization algorithm(頁面存檔備份,存於網際網路檔案館)
- Googling for InChIs(頁面存檔備份,存於網際網路檔案館) a presentation to the W3C.
- The Semantic Chemical Web: GoogleInChI and other Mashups(頁面存檔備份,存於網際網路檔案館), Google Tech Talk by Peter Murray-Rust, 13 Sept 2006
- IUPAC InChI(頁面存檔備份,存於網際網路檔案館), Google Tech Talk by Steve Heller and Steve Stein, 2 November 2006
- InChI Release 1.02 InChI final version 1.02 and explanation of Standard InChI, January 2009
軟體和服務
[編輯]- NCI/CADD Chemical Identifier Resolver(頁面存檔備份,存於網際網路檔案館) Generates and resolves InChI/InChIKeys and many other chemical identifiers
- ChemSpider InChI resolver(頁面存檔備份,存於網際網路檔案館)
- Search Google for molecules (generates InChI from interactive chemical and searches Google for any pages with embedded InChIs). Requires Javascript enabled on browser
- ChemSketch(頁面存檔備份,存於網際網路檔案館), free chemical structure drawing package that includes input and output in InCHI format
- PubChem online molecule editor(頁面存檔備份,存於網際網路檔案館) that supports SMILES/SMARTS and InChI
- ChemSpider Services(頁面存檔備份,存於網際網路檔案館) that allows generation of InChI and conversion of InChI to structure (also SMILES and generation of other properties)
- MarvinSketch from ChemAxon, implementation to draw structures (or open other file formats) and output to InChI file format
- BKchem(頁面存檔備份,存於網際網路檔案館) implements its own InChI parser and uses the IUPAC implementation to generate InChI strings
- CompoundSearch(頁面存檔備份,存於網際網路檔案館) implements an InChI and InChI Key search of spectral libraries
- JNI-InChI(頁面存檔備份,存於網際網路檔案館) Java library that wraps the InChI library
- the Chemistry Development Kit uses JNI-InChI to generate InChIs, can convert InChIs into structures, and generate tautomers based on the InChI algorithms
- Bioclipse generates InChI and InChIKeys for drawn structures or opened files
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