童元镇,明朝将领,广西桂林右卫(今广西桂林市)人。
万历二十八年(1600年),童元镇由指挥进升为都督佥事、广西总兵官,多次镇压瑶民起事。历任广东、浙江、贵州总兵官。跟随李化龙平定播州杨应龙之乱,督永顺、镇雄、泗城诸土军,自铜仁由乌江进兵,中埋伏,大败。所部三万人,不剩十分之一,将校只有谢崇爵等三人幸存,江水为之不流。被捉拿至北京,贬戍到烟瘴之地。在戍所去世。