着色菌目

着色菌目
科學分類
域：	細菌域 Bacteria
門：	假單胞菌門 Pseudomonadota
綱：	γ-變形菌綱 Gammaproteobacteria
目：	着色菌目 Chromatiales
科
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着色菌目（學名：Chromatiales）是變形菌門下的一類能夠進行光合作用的細菌，也被稱為紫硫菌（purple sulfur bacteria）。着色菌目的細菌是厭氧生物，常生活在硫磺泉或靜水中。綠色植物和藻類行光合作用時會將水作為還原劑，使水被氧化成氧氣，紫硫菌則是將硫化氫氧化成顆粒狀的硫，再被氧化為硫酸。

着色菌目分兩個科：着色菌科和外硫紅螺菌科，其區分在於它們是內部還是外部產生硫顆粒，此外其內部的膜也有區別。鹽硫杆狀菌科也屬於着色菌目，它只有一個屬，而且不能進行光合作用。

着色菌目細菌一般生存在湖泊有光的無氧區域或者硫化氫聚集的水域，比如在硫磺泉，在這些地質化學和生物導致的硫化氫環境中着色菌目甚至會大量繁殖，導致水變色。着色菌目必須需要無氧環境來進行光合作用。在有氧環境下它們無法生存。^[1]

最容易產生着色菌目細菌的湖泊是分層湖。這些湖泊的下層有比較重的水（一般鹽水），表面水比較輕（淡水）。假如在周圍土壤中有足夠硫酸鹽滲透進入無氧水層的話這裏可能形成密集的着色菌目細菌層，一般它們與綠色的光合作用的細菌混在一起。

下屬分類

本科包括以下屬：

Aquichromatiaceae Yang et al. 2017
着色桿菌科 Chromatiaceae Bavendamm 1924 (Approved Lists 1980)
外硫紅螺旋菌科 Ectothiorhodospiraceae Imhoff 1984
顆粒狀球菌科 Granulosicoccaceae Lee et al. 2008
Halorhodospiraceae Imhoff et al. 2023
鹽硫杆狀菌科 Halothiobacillaceae Kelly and Wood 2005
Poriferisulfidaceae Chuvochina et al. 2023
Sedimenticolaceae
Slobodkina et al. 2024^[2]
- Endoriftia Robidart et al. 2008
- Sedimenticola Narasingarao and Häggblom 2006
  - Sedimenticola endophacoides Lim et al. 2019
  - Sedimenticola hydrogenitrophicus Slobodkina et al. 2024^[3]
  - Sedimenticola selenatireducens Narasingarao and Häggblom 2006
  - Sedimenticola thiotaurini Flood et al. 2015
- Thiodiazotropha König et al. 2016
- Thiolapillus Nunoura et al. 2015
Thioalkalibacteraceae
Boden 2017
- Guyparkeria Boden 2017
- Thioalkalibacter Banciu et al. 2009
Thioalkalispiraceae
Mori et al. 2011
- Endothiovibrio Bazylinski et al. 2017
- Thioalkalispira Sorokin et al. 2002
- Thiohalophilus Sorokin et al. 2007
Thioprofundaceae Kojima et al. 2017
向文洲菌科 Wenzhouxiangellaceae Wang et al. 2015
Woeseiaceae Du et al. 2016

參考資料

^ Proctor, Lita M. (1997). "Nitrogen-fixing, photosynthetic, anaerobic bacteria associated with pelagic copepods （頁面存檔備份，存於互聯網檔案館）," Aquatic Microbial Ecology Vol. 12, 105-113.
^ Slobodkina G, Merkel A, Ratnikova N, Kuchierskaya A, Slobodkin A. Sedimenticola hydrogenitrophicus sp. nov. a chemolithoautotrophic bacterium isolated from a terrestrial mud volcano, and proposal of Sedimenticolaceae fam. nov. in the order Chromatiales. Syst Appl Microbiol 2023; 46:126451.
^ Slobodkina G, Merkel A, Ratnikova N, Kuchierskaya A, Slobodkin A. Sedimenticola hydrogenitrophicus sp. nov. a chemolithoautotrophic bacterium isolated from a terrestrial mud volcano, and proposal of Sedimenticolaceae fam. nov. in the order Chromatiales. Syst Appl Microbiol 2023; 46:126451.

[1] Proctor, Lita M. (1997). "Nitrogen-fixing, photosynthetic, anaerobic bacteria associated with pelagic copepods （頁面存檔備份，存於互聯網檔案館）," Aquatic Microbial Ecology Vol. 12, 105-113.

[2] Slobodkina G, Merkel A, Ratnikova N, Kuchierskaya A, Slobodkin A. Sedimenticola hydrogenitrophicus sp. nov. a chemolithoautotrophic bacterium isolated from a terrestrial mud volcano, and proposal of Sedimenticolaceae fam. nov. in the order Chromatiales. Syst Appl Microbiol 2023; 46:126451.

[3] Slobodkina G, Merkel A, Ratnikova N, Kuchierskaya A, Slobodkin A. Sedimenticola hydrogenitrophicus sp. nov. a chemolithoautotrophic bacterium isolated from a terrestrial mud volcano, and proposal of Sedimenticolaceae fam. nov. in the order Chromatiales. Syst Appl Microbiol 2023; 46:126451.

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