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希拉蒂亚·达萨马

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希拉蒂亚·达萨马
Shiladitya DasSarma
出生 (1957-11-11) 1957年11月11日（66岁）
 印度加尔各答
国籍 美国
母校印第安纳大学布卢明顿分校（英语：Indiana University Bloomington）（BS）
麻省理工学院（PhD）
知名于盐杆菌纲、气候行动
奖项玛格丽特·马克维卡奖（英语：Margaret MacVicar）
科学生涯
研究领域分子生物学
机构马里兰大学

希拉蒂亚·达萨马（英语：Shiladitya DasSarma，1957年11月11日—）是一名印度裔美国分子生物学家，因其对嗜卤和嗜极微生物生物学的贡献而知名[1][2]。他是马里兰大学巴尔的摩分校（英语：University of Maryland, Baltimore）的教授。他拥有印第安纳大学布卢明顿分校（英语：Indiana University Bloomington）化学学士学位和麻省理工学院生物化学博士学位。在担任教职之前，他曾在麻省总医院、哈佛医学院和巴黎巴斯德研究院从事研究工作。

达萨马曾在马萨诸塞大学阿默斯特分校（1986年—2001年）、马里兰大学生物技术研究所（英语：University of Maryland Biotechnology Institute）（2001年—2010年）和马里兰大学医学院海洋与环境技术研究所（2010年—至今）任教。他是分子遗传学、基因组学和生物资讯学的研究员和教师，也是本科生、研究生、博士后和青年教师的导师。他在嗜盐生物（英语：Halophile）[3]和嗜极生物研究领域的奠基作用广为人知。

研究工作

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嗜盐生物

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1980年代，达萨马在麻省理工学院与哈尔·葛宾·科拉纳和乌塔姆·L·拉吉班达里（Uttam L. RajBhandary）一起攻读研究生期间，发现嗜盐古细菌中的移动遗传因子[4][5]。他也发现古细菌[6]的转录启动子与普通细菌的转录启动子不同，这有助于人们接受卡尔·乌斯所提出的三域演化观点。

1990年代，他组织并领导团队破解第一个嗜盐微生物--盐杆菌NRC-1的基因组序列和遗传密码[7][8][9]。这项工作表明，它的蛋白质具有很强的酸性，让人们了解到蛋白质在高盐度和低水活性条件下是如何发挥作用的[10][11][12]。基因组序列发现了古细菌与高等真核生物的相似之处以及与细菌的不同之处，从而进一步确定古细菌的有效性[13]。

2000年代后期，他的工作也表明某些基因是透过水平基因转移获得的，例如有氧呼吸基因。他实验室的后基因组研究确定了嗜盐古细菌的核心蛋白质和特征蛋白[14]，以及许多基因和遗传因子的功能，包括多个复制起源[15]、一般转录因子[16]和DNA修复系统[17][18]。

天体生物学

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2010年代，达萨玛对南极嗜盐微生物Halorubrum lacusprofundi（英语：Halorubrum lacusprofundi）的研究进一步加深人们对高盐度和低温条件下蛋白质功能的理解[19]。这些研究可以解释生命如何适应新环境，包括地外环境[20]。

他提出最初在嗜盐古细菌中发现的视黄醛色素可能早于早期地球的叶绿素色素，并将其命名为“紫色地球假说”[2][21]。这项提议为远端探测生命提供了一个潜在的新生命印迹。

生物技术

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达萨马的实验室在研究Halobacterium sp. NRC-1中的浮力气囊奈米颗粒 (GVNPs) 方面发挥重要作用，并开发了一种表达系统，用于生物工程GVNPs的生物技术应用[22]。这些奈米粒子可能是抗原递送、疫苗开发及其他生物医学和环境应用的宝贵平台[23][24]。

参考资料

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  1. ^ Extreme Halophiles Are Models for Astrobiology (PDF). Microbe. 2006 [2023-12-17]. （原始内容存档 (PDF)于2016-08-07）. 
  2. ^ 2.0 2.1 Extreme Microbes » American Scientist. www.americanscientist.org. [2016-07-11]. （原始内容存档于2017-06-19）. 
  3. ^ DasSarma, Shiladitya; DasSarma, Priya. Halophiles. John Wiley & Sons, Ltd. 2001-01-01. ISBN 9780470015902. doi:10.1002/9780470015902.a0000394.pub3 （英语）. 
  4. ^ Simsek, M.; DasSarma, S.; RajBhandary, U. L.; Khorana, H. G. A transposable element from Halobacterium halobium which inactivates the bacteriorhodopsin gene. Proceedings of the National Academy of Sciences. 1982-12-01, 79 (23): 7268–7272. Bibcode:1982PNAS...79.7268S. ISSN 0027-8424. PMC 347320 可免费查阅. PMID 6296826. doi:10.1073/pnas.79.23.7268 可免费查阅 （英语）. 
  5. ^ DasSarma, S.; RajBhandary, U. L.; Khorana, H. G. High-frequency spontaneous mutation in the bacterio-opsin gene in Halobacterium halobium is mediated by transposable elements. Proceedings of the National Academy of Sciences. 1983-04-01, 80 (8): 2201–2205. Bibcode:1983PNAS...80.2201D. ISSN 0027-8424. PMC 393786 可免费查阅. PMID 6300900. doi:10.1073/pnas.80.8.2201 可免费查阅 （英语）. 
  6. ^ DasSarma, Shiladitya; RajBhandary, Uttam L.; Khorana, H. Gobind. Bacterio-opsin mRNA in wild-type and bacterio-opsin-deficient Halobacterium halobium strains. Proceedings of the National Academy of Sciences. 1984-01-01, 81 (1): 125–129. Bibcode:1984PNAS...81..125D. ISSN 0027-8424. PMC 344623 可免费查阅. PMID 16593404. doi:10.1073/pnas.81.1.125 可免费查阅 （英语）. 
  7. ^ Ng, WaiLap V.; Ciufo, Stacy A.; Smith, Todd M.; Bumgarner, Roger E.; Baskin, Dale; Faust, Janet; Hall, Barbara; Loretz, Carol; Seto, Jason. Snapshot of a Large Dynamic Replicon in a Halophilic Archaeon: Megaplasmid or Minichromosome?. Genome Research. 1998-11-01, 8 (11): 1131–1141. ISSN 1088-9051. PMID 9847077. doi:10.1101/gr.8.11.1131 可免费查阅 （英语）. 
  8. ^ Ng, Wailap Victor; Kennedy, Sean P.; Mahairas, Gregory G.; Berquist, Brian; Pan, Min; Shukla, Hem Dutt; Lasky, Stephen R.; Baliga, Nitin S.; Thorsson, Vesteinn. Genome sequence of Halobacterium species NRC-1. Proceedings of the National Academy of Sciences. 2000-10-24, 97 (22): 12176–12181. ISSN 0027-8424. PMC 17314 可免费查阅. PMID 11016950. doi:10.1073/pnas.190337797 可免费查阅 （英语）. 
  9. ^ NSF - OLPA - PR 00-69: International Research Group Sequences Genome of Ubiquitous Microbe. www.nsf.gov. [2016-07-11]. （原始内容存档于2023-12-17）. 
  10. ^ Kennedy, Sean P.; Ng, Wailap Victor; Salzberg, Steven L.; Hood, Leroy; DasSarma, Shiladitya. Understanding the Adaptation of Halobacterium Species NRC-1 to Its Extreme Environment through Computational Analysis of Its Genome Sequence. Genome Research. 2001-10-01, 11 (10): 1641–1650. ISSN 1088-9051. PMC 311145 可免费查阅. PMID 11591641. doi:10.1101/gr.190201 （英语）. 
  11. ^ Karan, Ram; Capes, Melinda D.; DasSarma, Shiladitya. Function and biotechnology of extremophilic enzymes in low water activity. Aquatic Biosystems. 2012-01-01, 8 (1): 4. ISSN 2046-9063. PMC 3310334 可免费查阅. PMID 22480329. doi:10.1186/2046-9063-8-4 可免费查阅. 
  12. ^ DasSarma, Shiladitya; DasSarma, Priya. Halophiles and their enzymes: negativity put to good use. Current Opinion in Microbiology. Environmental microbiology • Extremophiles. 2015-06-01, 25: 120–126. PMC 4729366 可免费查阅. PMID 26066288. doi:10.1016/j.mib.2015.05.009. 
  13. ^ DasSarma, S., J.A. Coker, and P. DasSarma. 2010. Archaea - Overview. In Encyclopedia of Microbiology, 3rd edition, Academic Press, M. Schaechter (ed.), p. 118-139.
  14. ^ Capes, Melinda D.; DasSarma, Priya; DasSarma, Shiladitya. The core and unique proteins of haloarchaea. BMC Genomics. 2012-01-01, 13: 39. ISSN 1471-2164. PMC 3287961 可免费查阅. PMID 22272718. doi:10.1186/1471-2164-13-39 可免费查阅. 
  15. ^ Berquist, Brian R.; DasSarma, Shiladitya. An Archaeal Chromosomal Autonomously Replicating Sequence Element from an Extreme Halophile, Halobacterium sp. Strain NRC-1. Journal of Bacteriology. 2003-10-15, 185 (20): 5959–5966. ISSN 0021-9193. PMC 225043 可免费查阅. PMID 14526006. doi:10.1128/JB.185.20.5959-5966.2003 （英语）. 
  16. ^ Coker, James A.; DasSarma, Shiladitya. Genetic and transcriptomic analysis of transcription factor genes in the model halophilic Archaeon: coordinate action of TbpD and TfbA. BMC Genetics. 2007-01-01, 8: 61. ISSN 1471-2156. PMC 2121645 可免费查阅. PMID 17892563. doi:10.1186/1471-2156-8-61 可免费查阅. 
  17. ^ Karan, R; DasSarma, P; Balcer-Kubiczek, E; Weng, RR; Liao, CC; Goodlett, DR; Ng, WV; Dassarma, S. Bioengineering radioresistance by overproduction of RPA, a mammalian-type single-stranded DNA-binding protein, in a halophilic archaeon. Applied Microbiology and Biotechnology. 2014, 98 (4): 1737–1747. PMC 4096848 可免费查阅. PMID 24292079. doi:10.1007/s00253-013-5368-x. 
  18. ^ Weiss, Rick. 'Superbugs' Could Benefit Humans. The Washington Post. 2007-09-25 [2016-07-11]. ISSN 0190-8286. （原始内容存档于2016-12-29） （美国英语）. 
  19. ^ DasSarma, Shiladitya; Capes, Melinda D.; Karan, Ram; DasSarma, Priya. Amino Acid Substitutions in Cold-Adapted Proteins from Halorubrum lacusprofundi , an Extremely Halophilic Microbe from Antarctica. PLOS ONE. 2013-03-11, 8 (3): e58587. Bibcode:2013PLoSO...858587D. ISSN 1932-6203. PMC 3594186 可免费查阅. PMID 23536799. doi:10.1371/journal.pone.0058587 可免费查阅. 
  20. ^ BioTechniques - Antarctic Microbe's Survival Tricks Revealed. www.biotechniques.com. [2016-07-11]. （原始内容存档于2016-09-13）. 
  21. ^ Extremophiles and Extraterrestrial Life. [2023-12-17]. （原始内容存档于2023-12-17）. 
  22. ^ DasSarma, Shiladitya; Karan, Ram; DasSarma, Priya; Barnes, Susan; Ekulona, Folasade; Smith, Barbara. An improved genetic system for bioengineering buoyant gas vesicle nanoparticles from Haloarchaea. BMC Biotechnology. 2013-01-01, 13: 112. ISSN 1472-6750. PMC 3878110 可免费查阅. PMID 24359319. doi:10.1186/1472-6750-13-112 可免费查阅. 
  23. ^ DasSarma, P.; Negi, V. D.; Balakrishnan, A.; Kim, J. -M.; Karan, R.; Chakravortty, D.; DasSarma, S. Procedia of the 8th Vaccine & ISV Congress, Philadelphia, USA, 2015Haloarchaeal Gas Vesicle Nanoparticles Displaying Salmonella Antigens as a Novel Approach to Vaccine Development. Procedia in Vaccinology. 2015-01-01, 9: 16–23. PMC 4758358 可免费查阅. PMID 26900411. doi:10.1016/j.provac.2015.05.003. 
  24. ^ DasSarma, Shiladitya; DasSarma, Priya. Gas Vesicle Nanoparticles for Antigen Display. Vaccines. 2015-09-07, 3 (3): 686–702. PMC 4586473 可免费查阅. PMID 26350601. doi:10.3390/vaccines3030686 可免费查阅 （英语）. 

外部链接

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