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黄鼠冠状病毒HKU24

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黄鼠冠状病毒HKU24
病毒分类 编辑
(未分级) 病毒 Virus
域: 核糖病毒域 Riboviria
界: 正核糖病毒界 Orthornavirae
门: 小核糖病毒门 Pisuviricota
纲: 小南嵌套病毒纲 Pisoniviricetes
目: 套式病毒目 Nidovirales
科: 冠状病毒科 Coronaviridae
属: 乙型冠状病毒属 Betacoronavirus
种:
黄鼠冠状病毒HKU24 China Rattus Coronavirus HKU24

中国鼠冠状病毒HKU24(China Rattus Coronavirus HKU24、ChRCoVHKU24)是乙型冠状病毒属的一种病毒,在香港广州大鼠肠道中被发现,于2015年由香港大学的研究人员发表[1]

基因组

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中国鼠冠状病毒HKU24的基因组约长31200nt,编码冠状病毒皆有的复制酶(1a/1b)和刺突蛋白(S)、膜蛋白(M)、外膜蛋白(E)与衣壳蛋白(N)等四种结构蛋白,另外还有血细胞凝集素酯酶英语Hemagglutinin esterase(HE)以及NS2a、NS4、NS5与N2等四种辅助蛋白,其基因顺序为1ab-NS2-HE-S-NS4-NS5-E-M-N2-N[1]

演化

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序列分析显示中国鼠冠状病毒HKU24在乙型冠状病毒1型牛冠状病毒人类冠状病毒OC43猪凝血性脑脊髓炎病毒等)的基部形成一演化支,显示此病毒可能是乙型冠状病毒1型(包含兔冠状病毒HKU14)的姊妹群,和同亚属中亦感染鼠类的鼠冠状病毒则关系较远。此病毒的演化地位显示可感染多种动物的乙型冠状病毒1型最早可能是由鼠类病毒演化而来。此病毒与乙型冠状病毒1型、鼠冠状病毒、人类冠状病毒HKU1等共同组成一演化支支序A(lineage A),此演化支的病毒基因组中皆编码血细胞凝集素酯酶(HE),其他冠状病毒则无[1][2]

参见

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参考文献

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  1. ^ 1.0 1.1 1.2 Lau, Susanna K. P.; Woo, Patrick C. Y.; Li, Kenneth S. M.; Tsang, Alan K. L.; Fan, Rachel Y. Y.; Luk, Hayes K. H.; Cai, Jian-Piao; Chan, Kwok-Hung; Zheng, Bo-Jian. Sandri-Goldin, R. M. , 编. Discovery of a Novel Coronavirus, China Rattus Coronavirus HKU24, from Norway Rats Supports the Murine Origin of Betacoronavirus 1 and Has Implications for the Ancestor of Betacoronavirus Lineage A. Journal of Virology. 2015-03-15, 89 (6): 3076–3092 [2022-01-27]. ISSN 0022-538X. PMC 4337523可免费查阅. PMID 25552712. doi:10.1128/JVI.02420-14. (原始内容存档于2022-05-13) (英语). 
  2. ^ Woo, Patrick C. Y.; Huang, Yi; Lau, Susanna K. P.; Yuen, Kwok-Yung. Coronavirus Genomics and Bioinformatics Analysis. Viruses. 2010-08-24, 2 (8): 1804–1820 [2022-01-27]. ISSN 1999-4915. PMC 3185738可免费查阅. PMID 21994708. doi:10.3390/v2081803. (原始内容存档于2022-05-07) (英语). In all members of Betacoronavirus subgroup A, a haemagglutinin esterase (HE) gene, which encodes a glycoprotein with neuraminate O-acetyl-esterase activity and the active site FGDS, is present downstream to ORF1ab and upstream to S gene (Figure 1).